Tomáš Thon jest absolwentem Akademii Sztuk Scenicznych w Pradze oraz Konserwatorium Narodowego Rueil-Malmaison w Paryżu.
Uczestniczył w wielu kursach organowych: w Czechach, Polsce i we Francji. Otrzymał drugą nagrodę w konkursie dla młodych organistów w Opawie i został finalistą międzynarodowych konkursów we Francji i w Niemczech.
Zajmuje się przede wszystkim historycznym wykonawstwem muzyki baroku oraz muzyką XX wieku. We współpracy z Czeskim Radiem dokonał nagrania wszystkich dzieł organowych Domenico Zipoliego i J. K. Smitha.
Regularnie zasiada w jury konkursów krajowych i międzynarodowych (Opawa, Vamberk, Rzym, Katowice) oraz prowadzi kursy mistrzowskie w zakresie interpretacji muzyki organowej (Francja, Polska, Austria, USA). Uczył w konserwatoriach w Kromieryżu, Ostrawie, Opawie i Ołomuńcu. W 1992 roku założył wydawnictwo muzyczne ARTTHON, które publikuje głównie czeską muzykę organową XVI-XVIII wieku.
W latach 2002-2008 organizował Międzynarodowy Festiwal Muzyki Barokowej w Opawie. W latach 2017 i 2018 odbył studia doktoranckie na Uniwersytecie w Ostrawie i Uniwersytecie Karola w Pradze.
Koncertował w większości krajów europejskich, Algierii i Stanach Zjednoczonych.
Toccata C-durFuga D-dur
Fuga gis-moll-D-dur
Fuga in gis
Fuga c-moll
Fuga a-moll
Fuga F-dur (na temat Laudetur Jesus Christus)
Preludium c-moll
Fuga c-moll (na temat Kyrie z Requiem solemne, red. R. Führer)
Fuga a-moll
Præludium. Mobile Perpetuum
Fuga f-moll (Gdy Prusacy Pragę bombardowali w roku 1757)
Præludium in F
Præludium Ex D
Præludium Ex C
Adagio a-moll
Partita C-dur (na temat Alleluia Paschale)